KERORO军曹寄住在日向家，竟因沉迷高达模型而惨变家务工人，更意外释放了一个来自“K隆星”远古时代的神秘武器KIRURU，令到全球大乱，面临毁灭危机！这时候，唯一知道如何拯救地球的谜样外星人突然现身，联同KERORO部队调转枪头，发动一…

从Ma隆星漂流到地球，长久以来相依为命的Ma隆星后裔Meru王子及随从Maru两人，心里一直惦念着要找到地球上最坚强且温柔的公主，进而重建自己的王国。然而，Meru及Maru两人心目中最理想的公主候选人，竟然就是KERORO小队中的队长kERO…