在电影开始开篇，场景好像被设置在一片大森林中。在森林内， 一声强力的呼救被一个叫Yukinari的男孩听到了。Yukinari是一个在残酷社会中比较天真的男孩，但这次经历对他来说是可能使他终身受益。当他进入森林的时候，他遇见一个叫Mik…

在这个布满运河及迷宫的美丽水都，小智、比卡超以及一班好朋友遇到拥有不可思议力量的宠物小精灵拉帝欧斯和拉帝亚斯，这对感情非常要好的兄妹一直默默地守护著水都的秘宝「心之结晶」。但是，一对怪盗姊妹看上这件秘宝并开始进行抢夺行动…

元军攻打日本之际，中国大陆的妖怪为了得到死者魂魄亦东渡日本。在这里，他们遭遇了犬夜叉的父亲斗牙王。经过一番艰苦鏖战，大陆妖怪最终被封印在斗牙王的牙齿中。时间回到战国时代，四魂之玉的一枚碎片飞到不归之森，唤醒了大陆妖怪首领…

终于达成少年时代的梦想而成为宇宙飞行员的武藏，在参加好朋友务的婚礼时，于塞班岛遇上异星人夏乌和吉恩。夏乌和吉恩的故乡，因为遭受宇宙怪兽山多洛斯的攻击而被毁灭，他们来到地球的海底世界Blue Area，希望能够研究出让故乡自然再生…

持续旅行的小智一行人，来到了被丰富自然的河川环绕的城镇米季纳。这个城镇里拥有数千年前的遗迹，小智等人在巨大的岩山上朝遗迹前进。在巨大的岩山上朝遗迹前进。突然，遗迹附近的湖刮起了水龙卷并向小智等人逼近，就在快被龙卷风卷入时…

以决斗守护新童实野市的不动游星被为了毁灭世界而从未来世界来的神秘男子·帕拉多克斯夺走作为自己王牌怪兽的星尘龙。 游星进行时间旅行，来到能使用卡片精灵力量的游城十代那里。游星在此得知事件的真相。那真相究竟是

超大型城市休特尔比尔特，不同种族的人民聚集于此，其中还有那些被称为“Next”的超能力者。“Next”群体曾经一度遭到歧视与迫害，而今早已和普通民众和平度日了。“Next”们依靠特殊的能力充当城市保护者的角色，当然作为城市的一员，他…

这是一个空前绝后的美食时代。 身为美食四天王之一的阿虏（置鲇龙太郎 配音），从未停下对未知而精美食材搜寻的脚步。某天，他接受一份委托，那便是寻找传说中的美食神阿卡西亚全套菜单“Special Menu”中的稀世食材。